ncbi中est是什么数据库

ncbi中est是什么数据库

NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,是一个提供生物信息学服务和资源的组织。NCBI维护着多个数据库,其中之一就是EST数据库。

EST(Expressed Sequence Tags)即表达序列标签,是一种用于快速鉴定和分析基因表达的方法。EST数据库是一个收集和存储EST序列的数据库,这些序列是从cDNA(亦称为mRNA)中得到的,代表了基因在特定组织或细胞中的表达情况。

EST序列是基因表达的短序列片段,通常为200-500个核苷酸,而整个基因组的序列通常是数万个核苷酸。EST序列的特点是它们来自于不同基因的表达产物,因此可以提供关于基因表达和功能的有用信息。

EST数据库中的序列通常是通过测序技术得到的,包括Sanger测序和高通量测序技术(如Illumina和454测序)。这些序列可以用于基因的注释、基因表达谱的分析、基因功能的研究等。

EST数据库中的序列可以通过NCBI网站进行访问和检索。用户可以使用关键词、基因名、物种名等进行搜索,并获取相关的EST序列及其注释信息。此外,EST数据库还提供了一些工具和资源,如BLAST(基本局部比对搜索工具)和EST序列的聚类和比对结果等。

总之,EST数据库是NCBI提供的一个用于存储和分析EST序列的数据库,它为研究人员提供了一个有价值的资源,用于理解基因表达和功能。

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